MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01

Total Repeats: 7075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008757	CTG	2	6	79	84	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008757	TCG	2	6	113	118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008757	GGGC	2	8	141	148	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008757	TCC	2	6	205	210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008757	TAA	2	6	215	220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008757	CCAG	2	8	312	319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008757	CCG	2	6	355	360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008757	CCG	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008757	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008757	CATG	2	8	440	447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008757	CGG	2	6	558	563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582712
12	NC_008757	CGC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582712
13	NC_008757	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	121582712
14	NC_008757	GCCC	2	8	626	633	0 %	0 %	25 %	75 %	121582712
15	NC_008757	CTG	2	6	680	685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582712
16	NC_008757	AGA	2	6	728	733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582712
17	NC_008757	CCA	2	6	818	823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582712
18	NC_008757	GCA	2	6	884	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582712
19	NC_008757	TCA	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582712
20	NC_008757	CG	3	6	1019	1024	0 %	0 %	50 %	50 %	121582712
21	NC_008757	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008757	CTTC	2	8	1072	1079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008757	GTT	2	6	1089	1094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008757	TG	3	6	1157	1162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008757	CA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008757	GCT	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008757	AAG	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008757	CGT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582713
29	NC_008757	TTCT	2	8	1234	1241	0 %	75 %	0 %	25 %	121582713
30	NC_008757	GCC	2	6	1242	1247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582713
31	NC_008757	CCT	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582713
32	NC_008757	CCTGG	2	10	1398	1407	0 %	20 %	40 %	40 %	121582713
33	NC_008757	GTT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582713
34	NC_008757	GC	3	6	1450	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	121582713
35	NC_008757	CGGA	2	8	1487	1494	25 %	0 %	50 %	25 %	121582713
36	NC_008757	CACATC	2	12	1561	1572	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	121582714
37	NC_008757	CCA	2	6	1626	1631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582714
38	NC_008757	GGA	2	6	1760	1765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582714
39	NC_008757	GCG	2	6	1778	1783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582714
40	NC_008757	CG	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	121582714
41	NC_008757	CGC	2	6	1830	1835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582714
42	NC_008757	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582714
43	NC_008757	GCA	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582714
44	NC_008757	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582714
45	NC_008757	CTCGCC	2	12	2017	2028	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	121582714
46	NC_008757	CAG	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582714
47	NC_008757	GCA	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582714
48	NC_008757	TGC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582714
49	NC_008757	TGG	2	6	2181	2186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582714
50	NC_008757	CTGGC	2	10	2284	2293	0 %	20 %	40 %	40 %	121582714
51	NC_008757	TCCA	2	8	2324	2331	25 %	25 %	0 %	50 %	121582714
52	NC_008757	GCTG	2	8	2406	2413	0 %	25 %	50 %	25 %	121582714
53	NC_008757	GC	3	6	2465	2470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008757	G	6	6	2493	2498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008757	CAA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008757	GCCA	2	8	2513	2520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008757	GGC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008757	GTT	2	6	2590	2595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008757	CGG	2	6	2666	2671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008757	CGG	2	6	2685	2690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008757	GGT	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582715
62	NC_008757	GGAA	2	8	2752	2759	50 %	0 %	50 %	0 %	121582715
63	NC_008757	A	6	6	2816	2821	100 %	0 %	0 %	0 %	121582715
64	NC_008757	GCC	2	6	2845	2850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582715
65	NC_008757	TCA	2	6	2880	2885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582715
66	NC_008757	TGC	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582715
67	NC_008757	CATG	2	8	3027	3034	25 %	25 %	25 %	25 %	121582715
68	NC_008757	TGC	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582715
69	NC_008757	GTC	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582715
70	NC_008757	GCCG	2	8	3082	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	121582715
71	NC_008757	CTTCA	2	10	3094	3103	20 %	40 %	0 %	40 %	121582715
72	NC_008757	GGC	2	6	3118	3123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582715
73	NC_008757	TCG	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582715
74	NC_008757	CCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582715
75	NC_008757	GGT	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582715
76	NC_008757	GGCGC	2	10	3223	3232	0 %	0 %	60 %	40 %	121582715
77	NC_008757	CCAG	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	121582715
78	NC_008757	ACCG	2	8	3331	3338	25 %	0 %	25 %	50 %	121582715
79	NC_008757	A	6	6	3339	3344	100 %	0 %	0 %	0 %	121582715
80	NC_008757	AGC	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582715
81	NC_008757	AAG	2	6	3535	3540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582716
82	NC_008757	T	6	6	3541	3546	0 %	100 %	0 %	0 %	121582716
83	NC_008757	ACA	2	6	3601	3606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582716
84	NC_008757	TCA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582716
85	NC_008757	CTT	2	6	3684	3689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582716
86	NC_008757	T	7	7	3717	3723	0 %	100 %	0 %	0 %	121582716
87	NC_008757	AAGA	2	8	3775	3782	75 %	0 %	25 %	0 %	121582716
88	NC_008757	TC	3	6	3871	3876	0 %	50 %	0 %	50 %	121582716
89	NC_008757	TTC	2	6	3921	3926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582716
90	NC_008757	CTTT	2	8	3958	3965	0 %	75 %	0 %	25 %	121582716
91	NC_008757	T	6	6	4087	4092	0 %	100 %	0 %	0 %	121582716
92	NC_008757	ATTC	2	8	4116	4123	25 %	50 %	0 %	25 %	121582716
93	NC_008757	T	6	6	4167	4172	0 %	100 %	0 %	0 %	121582716
94	NC_008757	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	121582716
95	NC_008757	TTTA	2	8	4204	4211	25 %	75 %	0 %	0 %	121582716
96	NC_008757	TCT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582716
97	NC_008757	ACAT	2	8	4268	4275	50 %	25 %	0 %	25 %	121582716
98	NC_008757	A	6	6	4303	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	121582716
99	NC_008757	TCG	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
100	NC_008757	TGA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582716
101	NC_008757	TAT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582716
102	NC_008757	AGG	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582716
103	NC_008757	GC	3	6	4507	4512	0 %	0 %	50 %	50 %	121582716
104	NC_008757	GGC	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582716
105	NC_008757	CAT	2	6	4530	4535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582716
106	NC_008757	GCA	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582716
107	NC_008757	GGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582716
108	NC_008757	TGT	2	6	4671	4676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582716
109	NC_008757	A	6	6	4725	4730	100 %	0 %	0 %	0 %	121582716
110	NC_008757	GCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582716
111	NC_008757	GCT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
112	NC_008757	AGG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582716
113	NC_008757	AGC	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582716
114	NC_008757	TGC	2	6	4967	4972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
115	NC_008757	AC	3	6	5004	5009	50 %	0 %	0 %	50 %	121582716
116	NC_008757	CTG	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
117	NC_008757	GGT	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582716
118	NC_008757	TGC	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
119	NC_008757	ACC	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582716
120	NC_008757	CAC	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582716
121	NC_008757	CTG	3	9	5245	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
122	NC_008757	TGA	2	6	5271	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582716
123	NC_008757	CTT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582716
124	NC_008757	CTG	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
125	NC_008757	AGC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582716
126	NC_008757	TCGGT	2	10	5516	5525	0 %	40 %	40 %	20 %	121582716
127	NC_008757	GA	3	6	5577	5582	50 %	0 %	50 %	0 %	121582716
128	NC_008757	GTG	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582716
129	NC_008757	T	6	6	5619	5624	0 %	100 %	0 %	0 %	121582716
130	NC_008757	CGCT	2	8	5656	5663	0 %	25 %	25 %	50 %	121582716
131	NC_008757	GAT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582716
132	NC_008757	TGA	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582716
133	NC_008757	TGC	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582716
134	NC_008757	GGA	2	6	5824	5829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582716
135	NC_008757	AGC	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582716
136	NC_008757	T	6	6	5886	5891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008757	CGG	3	9	5914	5922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008757	CGG	2	6	5936	5941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008757	CTT	2	6	5978	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008757	ATC	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582717
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258	NC_008757	ACT	2	6	13130	13135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582724
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264	NC_008757	ACC	2	6	13402	13407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582724
265	NC_008757	TCA	2	6	13412	13417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582724
266	NC_008757	CGA	2	6	13419	13424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582724
267	NC_008757	GTT	2	6	13437	13442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582724
268	NC_008757	AGC	2	6	13471	13476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582724
269	NC_008757	ACC	2	6	13479	13484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582724
270	NC_008757	AGTTCG	2	12	13511	13522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121582724
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272	NC_008757	TGGCC	2	10	13586	13595	0 %	20 %	40 %	40 %	121582724
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399	NC_008757	GGC	2	6	19733	19738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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